緊急醫療應變中心透過緊急醫療管理系統，對災難事件進行全面的分析與監控，並根據該區域的災害潛勢、風險評估以及過往的經驗與檢討，規劃並實施緊急應變教育訓練及相關演習。除此之外，針對化學物質緊急事件及輻射傷害等特殊災害，中心也負責相關的教育訓練、演習與評估工作，以全面提升應變能力。